第2次超级机器人大战OG中包含着许多隐藏要素，以下是已知隐藏要素的合集。
1.机战D超级系主角机フォルテギガス：
47話「トーチカ奇襲」不让ジョッシュ、リム参与战斗(一次都不能进入战斗画面，并且不可以塞进母舰里)，并且6回合内到达指定地点入手本关SR
47話「トーチカ奇襲」结束时ジョッシュ、リム击坠数70以上
48話入手，可能存在其他条件
2.魔装机神系机体(サイバスター、ガッデス、ザムジード、ディアブロ、ヴァルシオーネ、グランヴェール、ガルガード)必杀技：
正树路线：17话结束时让マサキ、テュッティ、ミオ、プレシア四人击坠数合计100以上
琉妮路线：17话结束时让リューネ、ヤンロン、ザッシュ三人击坠数合计75以上
单路线满足条件后，合流后全部机体均取得必杀技
44話「特異点崩壊」マサキ、テュッティ、ミオ、ヤンロン四人习得必杀技回归
46話「リューネ・カプリッチオ」プレシア、リューネ、ザッシュ三人习得必杀技回归
ダイゼンガー内蔵武器追加
42话结束时ゼンガー击坠数60以上，过关入手
T-LINKセンサー、Gテリトリー(芯片)
21話「黒焔の狩人」全部我方角色每人击破2机以上(组队时sub角色击破的不算，必须是单人或者组队时的main角色击破才算)
ねじりハチマキ(芯片)
35話「漆黒の虎、氷の白刃」让ブリット说得虎王机
勇者の印(芯片)
37话ミチル击破至少3只迅雷量产型
高性能電子頭脳
41話「妄念に操られし者(前篇)」用ゼンガー击破ジンライ
42話「妄念に操られし者(後篇)」让ゼンガー和レーツェル与ジンライ邻接，然后用ゼンガー或レーツェル满足胜利条件
SSPドリンク(芯片)
46話「リューネ・カプリッチオ」用マサキ救出プレシア，过关入手
鋼の魂(芯片)
49話「闘志、炎に燃ゆる」过关时钢龙两个舰长レフィーナ&テツヤ分别击坠数55以上
ブーストハンマー(武器)
39話「狼と犬達」ゼオラ、アラド、ラト三人任意一个单机或者作为组队时的main角色击破シエンヌ或把她打到撤退，过关入手
シシオウブレード(武器)
满足以下条件40话过关入手
38話「四神邂逅」分别用ブリット/クスハ与雀武王发生战斗前对话2次
38話「四神邂逅」分别用ブリット/クスハ与雀武王发生战斗前对话2次
40話「蒼炎の逆鱗」分别用ブリット/クスハ与雀武王发生战斗前对话2次
40話「蒼炎の逆鱗」分别用ブリット/クスハ与雀武王发生战斗前对话2次
40話「蒼炎の逆鱗」过关时ブリット击坠数50以上。
MTDMシューター(武器)
43话关内让アイビス击坠8机以上，总击坠数50以上，过关入手
グラビトン・ランチャー(武器)
45话用イング击坠エグレッタ，
结束时イング击坠数70以上，
过关时输送机满HP
イング乘坐アッシュ时主动攻击エグレッタ，导致アッシュ伤害到一定程度触发剧情，过关入手
フリー・エレクトロン・キャノン(武器)
SP模式特典
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