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Multilocus是一款专门用来对多位点群体遗传数据进行分析的强大软件。尤其是，它允许各种基因型多样性指数，各种连锁不平衡指数，和群体分化的量度的计算，并允许一个来搜索亚群不共享多态性（并因此可能繁殖隔离）。此外，也有随机化例程，允许一个测试各种零假设。
运行解压程序之后进入主界面，接着用两个选项小菜单：
命令菜单：
O>打开新的数据文件
Q>退出
什么是您的命令？
如果输入0，则程序会要求输入文件名，然后尝试读取它。如果一切顺利，该程序将加载数据，并打印出它认为的格式是：单倍体或二倍体，一些位点，以及一些个人或隔离。随后，主菜单将会出现：
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