雷顿教授系列AVG游戏自《不可思议的小镇》《恶魔之箱》《最后的时间旅行》三部曲完结之后，玩家和开发商都意犹未尽，为此LEVEL 5又推出了系列的前传作品《雷顿教授与魔神之笛》。游戏以「解谜」为主题，通过各种谜题来让冒险故事发展下去。
雷顿教授收到老友的一封信，信中提到「神秘巨人出现，并接连破坏城镇……」。为此雷顿教授某日来到一个神秘的“雾之村”，并在这里初次与路克少年相遇。雷顿教授将与路克少年以及新女主人公亚裔美女莱米一同揭开“魔神传说”背后的秘密。
本作在游戏的构成上和该系列之前的作品相同，均以欣赏优秀的剧情和解开丰富的谜题为卖点。游戏的谜题数量和前作相比有所增加，并且出现的谜题均是全新的，和系列作品无一重复。游戏中为大家准备了提示硬币，利用它们就可以在解谜过程中获得提示，这样一些难解之谜也可以迎刃而解。游戏中还有几个类似于迷你游戏的小模式，玩家需要在游戏中解开谜题来获得与这些模式相关的物品，当完成这些小模式后，游戏中的谜题就会增加。
| 题目 | 题目出现地点 | 解答 |
| 001 | 序章-对话后 | 请您一定要来救我 |
| 002 | 第一章-雾谷-格兰桥通路-小孩 | ABD（影子） |
| 剧情谜语 | 格兰桥 | 左上角的那段绳子 |
| 003 | 去克拉克的家-被毁的民家-木箱 | 第三层右边第二个的红箱子 |
| 004 | 去克拉克的家-十字路-手推车 |  |
| 005 | 去克拉克的家-南停船处-男人 | 1.两猫过去 2.狗鸡过去 3.两猫回来 4.两鸡过去 5.两猫过去 |
| 006 | 特莱顿家庭院-信箱 |  |
| 007 | 玄关-拖把 | 10 |
游戏中在特定街道会出现一只老鼠在跑，点到它可以得到老鼠徽章，得到超过十个可以在第八章到十字路处找一位警察玩抓老鼠的游戏。
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